В 1998 г. и последующие годы после спада наметилась тенденция роста перевозок, что в сочетании с мерами по снижению себестоимости перевозок позволило повысить рентабельность работы отрасли. С целью повышения эффективности и качества железнодорожных перевозок, сбалансирования их стоимости для товаропроизводителей, снижения транспортной составляющей в конечной цене продукта Правительство Российской Федерации в мае 2001 г. приняло постановление «О Программе структурной реформы на железнодорожном транспорте». Программа рассчитана на 10 лет, до конца 2010 г. с постепенным и поэтапным осуществлением предусмотренных мероприятий. Предполагается создание государственного открытого акционерного общества «Российские железные дороги» (ОАО «РЖД»), 100% акций которого будут принадлежать государству, к которому перейдут от МПС функции хозяйствующего субъекта.